（映画のオープニングを思わせるような映像に、逆三角に「ポケ」の文字が書かれたロゴマークがアップされる）
忍者大戦争
（江戸を彷彿とさせるような時代。とある城にて…）
これは、まだ日本がいろんな国に
わかれていた頃のお話。
その中の、ある国のあるお城で
ある日、お姫様が…
（パワポケ１〜３に登場したのりかそっくりのお姫様が言う）
お姫様：ふふふふふ〜〜〜〜〜〜〜ん。世の中には、野球という遊びをする人形があるそうじゃ。わらわ、その【野球人形】とやらが見てみたいの〜〜〜〜〜〜〜（はあと）
（パワポケ３に登場した垣内監督そっくりの殿様は部下に命を下しました）
殿様：【野球人形】……？ううむ、どうやって手に入れたものか。そうだ、こんなときこそ【忍者】じゃ。使いのものを『風賀の国』に走らせい！
（パワポケおなじみの荒井３兄弟そっくりの家臣達が風賀の国へ向かいましたが…）
使い：む〜〜〜〜〜〜ん。わかったんだな〜〜〜〜。
かくして、【野球人形】を見つけ出す
依頼書をたずさえた３人が、
忍者の国、【風賀】へとむかったのだった。
（道端に落ちていた２色パンをめぐって大ゲンカ）
…ところがこの３人。
ささいなことが原因でケンカを
始めてしまい…
（ご機嫌斜めになった３兄弟はそれぞれ別行動をしてしまい…）
それぞれが別の忍者の里、
すなわち【火竜】・【水虎】・【月光】に依頼書を
もっていってしまったのだった。
（【火竜】の領主の任月、【水虎】の領主の教頭、【月光】の領主の野々村が言う）
ほどなく、３つの里の頭領たちは
このことに気づいた。
任月：なにぃ？われら【火竜】以外にも【野球人形】の仕事を頼んでいただとぉ？！
教頭：キーッ、なんですってぇ？！天秤にかけられるとは、わが【水虎】もナメられたものね！
野々村：このままだと、これまでの【月光】の仕事がタダ働きになってしまうのか？ただでさえお金がないのに！
３人：こうなったら戦争だ！
（城の屋根の上から満月を見る主人公）
こうして風賀の国の３つの里は
【野球人形】をきっかけに
壮絶な戦いに突入したのだった。
はたして、【野球人形】を手にするのは
いったいどこの里なのか？！